Thomas Keane es el líder del equipo del European Genome Phenome Archive (EGA) y el European Variation Archive (EVA) en EMBL-EBI. Es responsable de la planificación estratégica de EGA y EVA, es miembro del comité directivo de la Alianza Global para la Genómica y la Salud (GA4GH) y codirige el flujo de trabajo de Genómica a gran escala. Antes de unirse a EMBL-EBI como Líder de Equipo en 2016, Thomas dirigió el grupo de Infraestructura de Variación de Secuencia en el Programa de Genómica Computacional en el Wellcome Trust Sanger Institute. Sus intereses de investigación están en el uso de tecnologías genómicas para comprender los procesos biológicos, con un enfoque particular en modelos de roedores para enfermedades humanas. Él es el líder científico del proyecto Mouse Genomes, una colaboración con el Wellcome Sanger Institute. También tiene una cátedra honoraria en la Universidad de Nottingham.